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中山大學中山眼科中心單細胞轉錄組個性化數據線上分析系統項目


中山大學中山眼科中心就單細胞轉錄組個性化數據線上分析系統項目組織單一來源采購,評標工作已經結束,成交結果如下:

一、項目名稱:中山大學中山眼科中心單細胞轉錄組個性化數據線上分析系統

二、中標(成交)信息

供應商名稱:北京新抗元生物技術有限公司

供應商地址:北京市昌平區生命科學園路291B316-12

中標(成交)金額:人民幣壹拾貳萬元整(¥120,000

三、主要標的信息

編號

功能模塊

描述

1

細胞屬性表

存儲、顯示細胞矩陣。

2

基因屬性表

存儲、顯示基因表達信息。

3

樣本屬性表

存儲、顯示樣本分組信息。

4

任務模塊

顯示任務、查看任務結果等。

5

圖庫模塊

任務中產生的圖永久存儲。

6

報告模塊

交付標準流程報告。

7

基因集

Marker基因。

8

細胞集

篩選過的細胞存儲顯示。

9

細胞定型

查看marker基因集聚類表達熱圖。

10

定型分組

存儲、顯示自定義分組信息。

11

樣本分組

存儲、合并、顯示自定義分組信息。

12

個人中心

修改密碼、樣本信息、幫組文檔等信息。

13

多級賬戶

多個賬戶可合并在一個賬戶里面管理。

14

表格工具

 

15

選擇

選擇數據信息,正選、反選。

16

顯示列配置

顯示想要看到的列,隱藏不想看到列。

17

固定列

固定顯示某一列或某多列。

18

復制列

復制某一列信息,可更改列內容。

19

篩選列

篩選某一列中內容,如大于100的數值、模糊某一列的字符。

20

保存集合

保存所選結果到細胞集、基因集。

 

細胞工具:

 

21

小提琴QC

使用小提琴圖展示各類細胞的QC分布。

22

Tsne/umap

tsne/umap/pca降維散點圖上顯示樣本、聚類、QC等信息。

23

差異基因分析

指定不同類或者不同樣本進行差異基因分析,對照組為空時,默認和處理組之外的所有細胞進行差異比較分析。

24

細胞異質性差異分析

計算亞群中所有細胞兩兩間的歐式距離并以箱線圖的形式表示其分布,距離分布越高則表示該亞群細胞異質性越高。

25

細胞比例差異分析

比較樣本或者分組之間各類細胞比例差異,尋找特有細胞亞群。

26

細胞軌跡分析

對選中的細胞進行偽時間排序,構建細胞擬時間序列軌跡,同時尋找與擬時間變化顯著相關的基因。

27

基因表達篩選

根據基因表達值篩選細胞。

28

聚類

重新聚類

 

基因工具:

 

29

GO富集分析

使用clusterProfiler對選中基因集進行GO富集分析。

30

KEGG富集分析

使用clusterProfiler對選中基因集進行Patahway富集分析。

31

Marker基因表達熱圖

使用熱圖展示所選基因在各個亞群或者樣本中的表達情況。

32

Marker基因表達小提琴圖

使用小提琴圖展示所選基因在各個亞群或者樣本中的表達分布。

33

Marker基因表達散點圖

使用降維后的細胞散點圖展示所選基因在每個細胞中的表達情況。

34

基因平均表達熱圖

使用熱圖快速展示所選基因在各個亞群或者樣本中的平均表達情況。

四、評審專家(單一來源采購人員)名單:

梁曉松、甄利雙、朱偉團、李翔,吳成、肖柳容、張草賢(采購人代表)

五、公告期限

自本公告發布之日起3個工作日。

凡對本次公告內容提出詢問,請按以下方式聯系。

聯系方式: 

信息科 肖柳容 TEL02087330352

監察室 敖老師 TEL02066618937

 

中山大學中山眼科中心

2021128

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